Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg1Q64343 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcg1Q64343 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcg1Q64343 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg1Q64343 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg1Q64343 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms