Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Supt6hQ62383 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Supt6hQ62383 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Supt6hQ62383 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Supt6hQ62383 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Supt6hQ62383 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Supt6hQ62383 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Supt6hQ62383 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Supt6hQ62383 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Supt6hQ62383 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Supt6hQ62383 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Supt6hQ62383 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Supt6hQ62383 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Supt6hQ62383 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Supt6hQ62383 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Supt6hQ62383 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Supt6hQ62383 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Supt6hQ62383 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Supt6hQ62383 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Supt6hQ62383 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Supt6hQ62383 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Supt6hQ62383 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Supt6hQ62383 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Supt6hQ62383 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Supt6hQ62383 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Supt6hQ62383 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Supt6hQ62383 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Supt6hQ62383 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Supt6hQ62383 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Supt6hQ62383 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Supt6hQ62383 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Supt6hQ62383 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Supt6hQ62383 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Supt6hQ62383 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Supt6hQ62383 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Supt6hQ62383 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Supt6hQ62383 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Supt6hQ62383 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Supt6hQ62383 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Supt6hQ62383 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Supt6hQ62383 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Supt6hQ62383 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms