Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ctr9Q62018 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ctr9Q62018 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ctr9Q62018 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ctr9Q62018 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ctr9Q62018 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ctr9Q62018 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ctr9Q62018 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ctr9Q62018 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ctr9Q62018 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ctr9Q62018 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ctr9Q62018 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ctr9Q62018 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctr9Q62018 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ctr9Q62018 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ctr9Q62018 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ctr9Q62018 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms