Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf3Q60803 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf3Q60803 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf3Q60803 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf3Q60803 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf3Q60803 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf3Q60803 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Traf3Q60803 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Traf3Q60803 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf3Q60803 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf3Q60803 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf3Q60803 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf3Q60803 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Traf3Q60803 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Traf3Q60803 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf3Q60803 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Traf3Q60803 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Traf3Q60803 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3Q60803 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3Q60803 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms