Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mkrn3Q60764 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Mkrn3Q60764 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mkrn3Q60764 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Mkrn3Q60764 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mkrn3Q60764 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mkrn3Q60764 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mkrn3Q60764 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mkrn3Q60764 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms