Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
P4ha1Q60715 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
P4ha1Q60715 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P4ha1Q60715 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4ha1Q60715 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
P4ha1Q60715 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.56■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P4ha1Q60715 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
P4ha1Q60715 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
P4ha1Q60715 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
P4ha1Q60715 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
P4ha1Q60715 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
P4ha1Q60715 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
P4ha1Q60715 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
P4ha1Q60715 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
P4ha1Q60715 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P4ha1Q60715 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
P4ha1Q60715 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
P4ha1Q60715 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
P4ha1Q60715 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
P4ha1Q60715 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
P4ha1Q60715 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
P4ha1Q60715 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
P4ha1Q60715 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms