Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CttnQ60598 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CttnQ60598 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CttnQ60598 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CttnQ60598 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CttnQ60598 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CttnQ60598 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CttnQ60598 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CttnQ60598 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CttnQ60598 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CttnQ60598 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CttnQ60598 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CttnQ60598 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CttnQ60598 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CttnQ60598 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CttnQ60598 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CttnQ60598 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CttnQ60598 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CttnQ60598 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CttnQ60598 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CttnQ60598 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CttnQ60598 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CttnQ60598 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CttnQ60598 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CttnQ60598 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CttnQ60598 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CttnQ60598 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CttnQ60598 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CttnQ60598 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CttnQ60598 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CttnQ60598 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CttnQ60598 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CttnQ60598 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms