Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd3Q52KB6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
C2cd3Q52KB6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2cd3Q52KB6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C2cd3Q52KB6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C2cd3Q52KB6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C2cd3Q52KB6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C2cd3Q52KB6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms