Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clul1Q3ZRW6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clul1Q3ZRW6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clul1Q3ZRW6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clul1Q3ZRW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clul1Q3ZRW6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clul1Q3ZRW6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clul1Q3ZRW6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clul1Q3ZRW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clul1Q3ZRW6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clul1Q3ZRW6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clul1Q3ZRW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clul1Q3ZRW6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clul1Q3ZRW6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clul1Q3ZRW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clul1Q3ZRW6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms