Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cracr2aQ3UP38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cracr2aQ3UP38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cracr2aQ3UP38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cracr2aQ3UP38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cracr2aQ3UP38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cracr2aQ3UP38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cracr2aQ3UP38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cracr2aQ3UP38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cracr2aQ3UP38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cracr2aQ3UP38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cracr2aQ3UP38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms