Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK37

Uncharacterized protein C14orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UK37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UK37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UK37 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3UK37 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UK37 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UK37 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3UK37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UK37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UK37 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UK37 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3UK37 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3UK37 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3UK37 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UK37 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UK37 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UK37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UK37 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UK37 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3UK37 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UK37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3UK37 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UK37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UK37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UK37 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UK37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UK37 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UK37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3UK37 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q3UK37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3UK37 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3UK37 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3UK37 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3UK37 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3UK37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3UK37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3UK37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UK37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UK37 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UK37 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UK37 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UK37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UK37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3UK37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3UK37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3UK37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UK37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UK37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3UK37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3UK37 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q3UK37 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UK37 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UK37 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UK37 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3UK37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UK37 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UK37 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UK37 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UK37 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UK37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UK37 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UK37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UK37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UK37 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UK37 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UK37 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UK37 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UK37 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UK37 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UK37 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UK37 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UK37 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UK37 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UK37 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UK37 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UK37 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UK37 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q3UK37 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UK37 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UK37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UK37 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UK37 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UK37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UK37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UK37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UK37 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UK37 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q3UK37 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3UK37 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q3UK37 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q3UK37 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3UK37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q3UK37 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3UK37 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3UK37 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Q3UK37 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UK37 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UK37 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UK37 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q3UK37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q3UK37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms