Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chrna5Q2MKA5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chrna5Q2MKA5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chrna5Q2MKA5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chrna5Q2MKA5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chrna5Q2MKA5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chrna5Q2MKA5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chrna5Q2MKA5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chrna5Q2MKA5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Chrna5Q2MKA5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chrna5Q2MKA5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Chrna5Q2MKA5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chrna5Q2MKA5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chrna5Q2MKA5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chrna5Q2MKA5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chrna5Q2MKA5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chrna5Q2MKA5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chrna5Q2MKA5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chrna5Q2MKA5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chrna5Q2MKA5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chrna5Q2MKA5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chrna5Q2MKA5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chrna5Q2MKA5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chrna5Q2MKA5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Chrna5Q2MKA5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chrna5Q2MKA5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chrna5Q2MKA5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chrna5Q2MKA5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chrna5Q2MKA5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chrna5Q2MKA5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna5Q2MKA5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna5Q2MKA5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna5Q2MKA5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chrna5Q2MKA5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chrna5Q2MKA5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chrna5Q2MKA5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chrna5Q2MKA5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chrna5Q2MKA5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Chrna5Q2MKA5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Chrna5Q2MKA5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms