Protein–RNA interactions for Protein: Q1WWJ5

Zfp386, Zinc finger protein 386 (Kruppel-like), mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp386Q1WWJ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp386Q1WWJ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp386Q1WWJ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp386Q1WWJ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp386Q1WWJ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp386Q1WWJ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp386Q1WWJ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp386Q1WWJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp386Q1WWJ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp386Q1WWJ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp386Q1WWJ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp386Q1WWJ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp386Q1WWJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp386Q1WWJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp386Q1WWJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp386Q1WWJ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp386Q1WWJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp386Q1WWJ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms