Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lingo4Q149C3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lingo4Q149C3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms