Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col19a1Q0VF58 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col19a1Q0VF58 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col19a1Q0VF58 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col19a1Q0VF58 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col19a1Q0VF58 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Col19a1Q0VF58 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col19a1Q0VF58 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col19a1Q0VF58 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col19a1Q0VF58 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col19a1Q0VF58 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col19a1Q0VF58 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col19a1Q0VF58 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col19a1Q0VF58 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col19a1Q0VF58 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col19a1Q0VF58 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col19a1Q0VF58 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col19a1Q0VF58 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms