Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms