Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ext1P97464 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ext1P97464 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ext1P97464 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ext1P97464 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ext1P97464 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ext1P97464 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ext1P97464 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ext1P97464 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ext1P97464 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ext1P97464 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext1P97464 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext1P97464 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ext1P97464 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ext1P97464 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ext1P97464 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext1P97464 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ext1P97464 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms