Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RptnP97347 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RptnP97347 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RptnP97347 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RptnP97347 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RptnP97347 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RptnP97347 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RptnP97347 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RptnP97347 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RptnP97347 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RptnP97347 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RptnP97347 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RptnP97347 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RptnP97347 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RptnP97347 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RptnP97347 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RptnP97347 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RptnP97347 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RptnP97347 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RptnP97347 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RptnP97347 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptnP97347 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptnP97347 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptnP97347 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptnP97347 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RptnP97347 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RptnP97347 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RptnP97347 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RptnP97347 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RptnP97347 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptnP97347 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RptnP97347 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptnP97347 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptnP97347 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptnP97347 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptnP97347 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptnP97347 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptnP97347 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptnP97347 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RptnP97347 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RptnP97347 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RptnP97347 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RptnP97347 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RptnP97347 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RptnP97347 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RptnP97347 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RptnP97347 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RptnP97347 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RptnP97347 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RptnP97347 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RptnP97347 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RptnP97347 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RptnP97347 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RptnP97347 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RptnP97347 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RptnP97347 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RptnP97347 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RptnP97347 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RptnP97347 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RptnP97347 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RptnP97347 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RptnP97347 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RptnP97347 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RptnP97347 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RptnP97347 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RptnP97347 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RptnP97347 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RptnP97347 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RptnP97347 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RptnP97347 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RptnP97347 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RptnP97347 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RptnP97347 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RptnP97347 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RptnP97347 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RptnP97347 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RptnP97347 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RptnP97347 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RptnP97347 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RptnP97347 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RptnP97347 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RptnP97347 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RptnP97347 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RptnP97347 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RptnP97347 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RptnP97347 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RptnP97347 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RptnP97347 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RptnP97347 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RptnP97347 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RptnP97347 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RptnP97347 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RptnP97347 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RptnP97347 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RptnP97347 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RptnP97347 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RptnP97347 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RptnP97347 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RptnP97347 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RptnP97347 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms