Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3r1P70441 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3r1P70441 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a3r1P70441 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a3r1P70441 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a3r1P70441 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3r1P70441 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc9a3r1P70441 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a3r1P70441 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a3r1P70441 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a3r1P70441 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9a3r1P70441 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a3r1P70441 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a3r1P70441 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3r1P70441 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3r1P70441 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3r1P70441 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3r1P70441 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms