Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbx1P70323 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbx1P70323 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbx1P70323 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbx1P70323 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx1P70323 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx1P70323 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx1P70323 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbx1P70323 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbx1P70323 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbx1P70323 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbx1P70323 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms