Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprvP70289 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprvP70289 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprvP70289 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PtprvP70289 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PtprvP70289 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprvP70289 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprvP70289 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprvP70289 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprvP70289 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprvP70289 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprvP70289 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprvP70289 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprvP70289 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprvP70289 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprvP70289 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprvP70289 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprvP70289 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprvP70289 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PtprvP70289 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PtprvP70289 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprvP70289 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprvP70289 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprvP70289 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprvP70289 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprvP70289 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprvP70289 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprvP70289 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PtprvP70289 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PtprvP70289 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprvP70289 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprvP70289 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprvP70289 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprvP70289 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprvP70289 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprvP70289 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprvP70289 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprvP70289 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprvP70289 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprvP70289 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprvP70289 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprvP70289 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprvP70289 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprvP70289 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtprvP70289 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprvP70289 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PtprvP70289 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PtprvP70289 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PtprvP70289 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprvP70289 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprvP70289 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PtprvP70289 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PtprvP70289 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprvP70289 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PtprvP70289 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprvP70289 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PtprvP70289 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprvP70289 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprvP70289 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprvP70289 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms