Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PklrP53657 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PklrP53657 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PklrP53657 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PklrP53657 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PklrP53657 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PklrP53657 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PklrP53657 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PklrP53657 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PklrP53657 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PklrP53657 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PklrP53657 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PklrP53657 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PklrP53657 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PklrP53657 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PklrP53657 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PklrP53657 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PklrP53657 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PklrP53657 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PklrP53657 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PklrP53657 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PklrP53657 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PklrP53657 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PklrP53657 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PklrP53657 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PklrP53657 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PklrP53657 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PklrP53657 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PklrP53657 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PklrP53657 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PklrP53657 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PklrP53657 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PklrP53657 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PklrP53657 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PklrP53657 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PklrP53657 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PklrP53657 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PklrP53657 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PklrP53657 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PklrP53657 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PklrP53657 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PklrP53657 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PklrP53657 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PklrP53657 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PklrP53657 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PklrP53657 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PklrP53657 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PklrP53657 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PklrP53657 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PklrP53657 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PklrP53657 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PklrP53657 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PklrP53657 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PklrP53657 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PklrP53657 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PklrP53657 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PklrP53657 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PklrP53657 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PklrP53657 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PklrP53657 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PklrP53657 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PklrP53657 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PklrP53657 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PklrP53657 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PklrP53657 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PklrP53657 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PklrP53657 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PklrP53657 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PklrP53657 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PklrP53657 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PklrP53657 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PklrP53657 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PklrP53657 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PklrP53657 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PklrP53657 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PklrP53657 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PklrP53657 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PklrP53657 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PklrP53657 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PklrP53657 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PklrP53657 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PklrP53657 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PklrP53657 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PklrP53657 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PklrP53657 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PklrP53657 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PklrP53657 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PklrP53657 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PklrP53657 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PklrP53657 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PklrP53657 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PklrP53657 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PklrP53657 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PklrP53657 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PklrP53657 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PklrP53657 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PklrP53657 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PklrP53657 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PklrP53657 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PklrP53657 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms