Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tmod1P49813 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmod1P49813 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmod1P49813 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmod1P49813 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmod1P49813 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmod1P49813 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmod1P49813 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmod1P49813 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmod1P49813 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmod1P49813 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmod1P49813 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmod1P49813 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmod1P49813 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmod1P49813 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmod1P49813 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmod1P49813 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tmod1P49813 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmod1P49813 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmod1P49813 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmod1P49813 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmod1P49813 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmod1P49813 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmod1P49813 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmod1P49813 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmod1P49813 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms