Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn1bP46414 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn1bP46414 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn1bP46414 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdkn1bP46414 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn1bP46414 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkn1bP46414 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkn1bP46414 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkn1bP46414 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms