Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HttP42859 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HttP42859 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HttP42859 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HttP42859 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HttP42859 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HttP42859 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HttP42859 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HttP42859 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HttP42859 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HttP42859 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HttP42859 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HttP42859 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HttP42859 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HttP42859 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HttP42859 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HttP42859 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HttP42859 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HttP42859 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HttP42859 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HttP42859 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HttP42859 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HttP42859 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HttP42859 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HttP42859 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HttP42859 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HttP42859 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HttP42859 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HttP42859 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HttP42859 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HttP42859 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HttP42859 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HttP42859 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HttP42859 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HttP42859 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HttP42859 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HttP42859 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HttP42859 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HttP42859 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HttP42859 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HttP42859 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HttP42859 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HttP42859 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HttP42859 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HttP42859 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HttP42859 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HttP42859 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HttP42859 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HttP42859 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HttP42859 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HttP42859 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HttP42859 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HttP42859 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HttP42859 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HttP42859 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HttP42859 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HttP42859 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HttP42859 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HttP42859 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HttP42859 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HttP42859 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HttP42859 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HttP42859 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HttP42859 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HttP42859 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HttP42859 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HttP42859 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HttP42859 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HttP42859 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HttP42859 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HttP42859 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HttP42859 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HttP42859 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HttP42859 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HttP42859 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HttP42859 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HttP42859 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HttP42859 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HttP42859 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HttP42859 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HttP42859 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HttP42859 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HttP42859 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HttP42859 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HttP42859 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HttP42859 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HttP42859 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HttP42859 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HttP42859 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HttP42859 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HttP42859 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
HttP42859 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HttP42859 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HttP42859 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HttP42859 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HttP42859 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HttP42859 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HttP42859 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HttP42859 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HttP42859 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms