Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Chd1P40201 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Chd1P40201 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Chd1P40201 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Chd1P40201 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Chd1P40201 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Chd1P40201 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Chd1P40201 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Chd1P40201 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Chd1P40201 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Chd1P40201 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Chd1P40201 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Chd1P40201 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Chd1P40201 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Chd1P40201 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Chd1P40201 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Chd1P40201 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Chd1P40201 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Chd1P40201 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Chd1P40201 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Chd1P40201 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Chd1P40201 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Chd1P40201 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Chd1P40201 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Chd1P40201 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Chd1P40201 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Chd1P40201 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Chd1P40201 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Chd1P40201 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Chd1P40201 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Chd1P40201 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Chd1P40201 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Chd1P40201 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Chd1P40201 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Chd1P40201 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Chd1P40201 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Chd1P40201 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Chd1P40201 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Chd1P40201 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Chd1P40201 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Chd1P40201 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Chd1P40201 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Chd1P40201 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Chd1P40201 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Chd1P40201 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Chd1P40201 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Chd1P40201 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Chd1P40201 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Chd1P40201 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Chd1P40201 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Chd1P40201 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Chd1P40201 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Chd1P40201 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Chd1P40201 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Chd1P40201 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Chd1P40201 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Chd1P40201 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Chd1P40201 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Chd1P40201 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Chd1P40201 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Chd1P40201 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Chd1P40201 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Chd1P40201 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Chd1P40201 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Chd1P40201 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Chd1P40201 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Chd1P40201 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Chd1P40201 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Chd1P40201 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Chd1P40201 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Chd1P40201 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Chd1P40201 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms