Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PtprkP35822 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PtprkP35822 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PtprkP35822 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PtprkP35822 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PtprkP35822 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PtprkP35822 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PtprkP35822 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PtprkP35822 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
PtprkP35822 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PtprkP35822 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PtprkP35822 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
PtprkP35822 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PtprkP35822 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PtprkP35822 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PtprkP35822 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PtprkP35822 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PtprkP35822 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PtprkP35822 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PtprkP35822 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PtprkP35822 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
PtprkP35822 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PtprkP35822 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
PtprkP35822 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PtprkP35822 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PtprkP35822 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PtprkP35822 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PtprkP35822 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PtprkP35822 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PtprkP35822 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PtprkP35822 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PtprkP35822 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PtprkP35822 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PtprkP35822 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PtprkP35822 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
PtprkP35822 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PtprkP35822 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PtprkP35822 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PtprkP35822 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PtprkP35822 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PtprkP35822 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PtprkP35822 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PtprkP35822 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
PtprkP35822 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PtprkP35822 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PtprkP35822 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PtprkP35822 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PtprkP35822 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PtprkP35822 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
PtprkP35822 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PtprkP35822 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PtprkP35822 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PtprkP35822 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PtprkP35822 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PtprkP35822 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PtprkP35822 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
PtprkP35822 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PtprkP35822 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PtprkP35822 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PtprkP35822 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms