Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sftpa1P35242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sftpa1P35242 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sftpa1P35242 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sftpa1P35242 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sftpa1P35242 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sftpa1P35242 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sftpa1P35242 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sftpa1P35242 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sftpa1P35242 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sftpa1P35242 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sftpa1P35242 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sftpa1P35242 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sftpa1P35242 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sftpa1P35242 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sftpa1P35242 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sftpa1P35242 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sftpa1P35242 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sftpa1P35242 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sftpa1P35242 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sftpa1P35242 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sftpa1P35242 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sftpa1P35242 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sftpa1P35242 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms