Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Notch4P31695 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Notch4P31695 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Notch4P31695 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Notch4P31695 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Notch4P31695 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Notch4P31695 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Notch4P31695 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Notch4P31695 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Notch4P31695 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Notch4P31695 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Notch4P31695 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Notch4P31695 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Notch4P31695 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Notch4P31695 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Notch4P31695 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Notch4P31695 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Notch4P31695 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Notch4P31695 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Notch4P31695 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Notch4P31695 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Notch4P31695 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Notch4P31695 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Notch4P31695 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Notch4P31695 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Notch4P31695 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms