Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htr3aP23979 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Htr3aP23979 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Htr3aP23979 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htr3aP23979 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Htr3aP23979 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Htr3aP23979 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr3aP23979 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms