Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd12P23812 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxd12P23812 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxd12P23812 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxd12P23812 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd12P23812 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd12P23812 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd12P23812 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd12P23812 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd12P23812 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd12P23812 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxd12P23812 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd12P23812 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd12P23812 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxd12P23812 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd12P23812 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms