Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irf8P23611 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irf8P23611 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irf8P23611 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irf8P23611 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irf8P23611 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Irf8P23611 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irf8P23611 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irf8P23611 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf8P23611 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irf8P23611 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf8P23611 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf8P23611 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Irf8P23611 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irf8P23611 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irf8P23611 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irf8P23611 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irf8P23611 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irf8P23611 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf8P23611 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf8P23611 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf8P23611 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf8P23611 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf8P23611 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf8P23611 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irf8P23611 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf8P23611 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irf8P23611 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms