Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhrP21761 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TrhrP21761 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrhrP21761 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhrP21761 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhrP21761 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhrP21761 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhrP21761 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhrP21761 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhrP21761 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhrP21761 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhrP21761 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhrP21761 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhrP21761 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhrP21761 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhrP21761 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhrP21761 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhrP21761 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhrP21761 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhrP21761 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrhrP21761 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrhrP21761 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrhrP21761 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhrP21761 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhrP21761 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms