Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama1P19137 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lama1P19137 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama1P19137 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama1P19137 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama1P19137 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama1P19137 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama1P19137 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama1P19137 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama1P19137 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lama1P19137 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lama1P19137 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lama1P19137 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lama1P19137 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lama1P19137 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lama1P19137 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lama1P19137 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lama1P19137 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lama1P19137 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama1P19137 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama1P19137 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama1P19137 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama1P19137 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama1P19137 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms