Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Lama1P19137 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Lama1P19137 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lama1P19137 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Lama1P19137 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Lama1P19137 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lama1P19137 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lama1P19137 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Lama1P19137 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lama1P19137 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lama1P19137 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Lama1P19137 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Lama1P19137 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lama1P19137 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lama1P19137 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lama1P19137 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lama1P19137 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lama1P19137 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lama1P19137 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lama1P19137 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lama1P19137 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Lama1P19137 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lama1P19137 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lama1P19137 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lama1P19137 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lama1P19137 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lama1P19137 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lama1P19137 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Lama1P19137 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lama1P19137 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lama1P19137 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Lama1P19137 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lama1P19137 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lama1P19137 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lama1P19137 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lama1P19137 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lama1P19137 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lama1P19137 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lama1P19137 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lama1P19137 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lama1P19137 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Lama1P19137 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Lama1P19137 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lama1P19137 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lama1P19137 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama1P19137 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lama1P19137 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lama1P19137 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lama1P19137 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lama1P19137 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Lama1P19137 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lama1P19137 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lama1P19137 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama1P19137 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama1P19137 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lama1P19137 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lama1P19137 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lama1P19137 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lama1P19137 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lama1P19137 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lama1P19137 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lama1P19137 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama1P19137 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama1P19137 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lama1P19137 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lama1P19137 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Lama1P19137 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lama1P19137 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lama1P19137 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama1P19137 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama1P19137 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lama1P19137 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lama1P19137 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lama1P19137 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama1P19137 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama1P19137 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama1P19137 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lama1P19137 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lama1P19137 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lama1P19137 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lama1P19137 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama1P19137 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama1P19137 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lama1P19137 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lama1P19137 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lama1P19137 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama1P19137 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama1P19137 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lama1P19137 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama1P19137 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lama1P19137 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama1P19137 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lama1P19137 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lama1P19137 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama1P19137 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lama1P19137 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lama1P19137 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lama1P19137 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama1P19137 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama1P19137 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms