Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb3P09026 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb3P09026 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb3P09026 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb3P09026 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb3P09026 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxb3P09026 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb3P09026 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb3P09026 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb3P09026 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb3P09026 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb3P09026 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb3P09026 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms