Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MybP06876 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MybP06876 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MybP06876 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MybP06876 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MybP06876 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MybP06876 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MybP06876 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MybP06876 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MybP06876 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MybP06876 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MybP06876 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MybP06876 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MybP06876 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MybP06876 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MybP06876 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MybP06876 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MybP06876 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MybP06876 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MybP06876 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MybP06876 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MybP06876 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MybP06876 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MybP06876 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MybP06876 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MybP06876 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MybP06876 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MybP06876 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MybP06876 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MybP06876 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MybP06876 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MybP06876 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MybP06876 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MybP06876 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MybP06876 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MybP06876 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MybP06876 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MybP06876 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MybP06876 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MybP06876 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MybP06876 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MybP06876 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MybP06876 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MybP06876 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MybP06876 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MybP06876 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MybP06876 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MybP06876 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MybP06876 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MybP06876 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MybP06876 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MybP06876 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MybP06876 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MybP06876 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MybP06876 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MybP06876 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MybP06876 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MybP06876 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MybP06876 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MybP06876 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MybP06876 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MybP06876 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MybP06876 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MybP06876 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MybP06876 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MybP06876 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MybP06876 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MybP06876 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MybP06876 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MybP06876 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MybP06876 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MybP06876 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MybP06876 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MybP06876 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MybP06876 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MybP06876 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MybP06876 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MybP06876 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MybP06876 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MybP06876 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MybP06876 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MybP06876 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MybP06876 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MybP06876 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MybP06876 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MybP06876 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MybP06876 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MybP06876 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MybP06876 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MybP06876 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MybP06876 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MybP06876 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MybP06876 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms