Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa4P06798 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa4P06798 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa4P06798 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa4P06798 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa4P06798 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxa4P06798 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa4P06798 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa4P06798 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa4P06798 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa4P06798 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa4P06798 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa4P06798 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxa4P06798 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa4P06798 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa4P06798 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms