Protein–RNA interactions for Protein: P03966

Mycn, N-myc proto-oncogene protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycnP03966 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MycnP03966 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MycnP03966 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MycnP03966 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MycnP03966 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MycnP03966 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MycnP03966 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MycnP03966 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MycnP03966 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MycnP03966 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MycnP03966 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MycnP03966 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MycnP03966 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MycnP03966 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MycnP03966 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MycnP03966 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MycnP03966 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MycnP03966 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MycnP03966 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MycnP03966 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MycnP03966 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MycnP03966 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MycnP03966 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MycnP03966 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MycnP03966 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MycnP03966 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MycnP03966 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MycnP03966 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MycnP03966 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MycnP03966 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MycnP03966 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MycnP03966 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MycnP03966 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MycnP03966 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MycnP03966 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MycnP03966 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MycnP03966 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MycnP03966 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MycnP03966 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MycnP03966 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MycnP03966 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MycnP03966 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MycnP03966 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MycnP03966 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MycnP03966 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MycnP03966 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MycnP03966 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MycnP03966 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MycnP03966 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MycnP03966 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MycnP03966 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MycnP03966 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MycnP03966 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MycnP03966 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MycnP03966 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MycnP03966 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MycnP03966 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MycnP03966 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MycnP03966 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MycnP03966 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MycnP03966 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MycnP03966 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MycnP03966 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MycnP03966 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MycnP03966 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MycnP03966 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MycnP03966 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MycnP03966 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MycnP03966 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MycnP03966 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MycnP03966 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MycnP03966 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MycnP03966 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MycnP03966 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MycnP03966 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MycnP03966 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MycnP03966 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MycnP03966 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MycnP03966 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MycnP03966 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MycnP03966 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MycnP03966 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MycnP03966 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MycnP03966 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MycnP03966 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MycnP03966 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MycnP03966 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MycnP03966 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MycnP03966 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MycnP03966 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MycnP03966 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MycnP03966 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MycnP03966 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MycnP03966 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MycnP03966 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MycnP03966 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MycnP03966 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MycnP03966 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MycnP03966 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MycnP03966 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms