Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Robo1O89026 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Robo1O89026 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Robo1O89026 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Robo1O89026 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Robo1O89026 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Robo1O89026 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Robo1O89026 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Robo1O89026 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Robo1O89026 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Robo1O89026 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Robo1O89026 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Robo1O89026 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Robo1O89026 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Robo1O89026 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Robo1O89026 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Robo1O89026 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Robo1O89026 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Robo1O89026 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Robo1O89026 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Robo1O89026 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Robo1O89026 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Robo1O89026 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Robo1O89026 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Robo1O89026 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Robo1O89026 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Robo1O89026 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Robo1O89026 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Robo1O89026 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Robo1O89026 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Robo1O89026 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Robo1O89026 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Robo1O89026 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Robo1O89026 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Robo1O89026 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms