Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CntfrO88507 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CntfrO88507 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CntfrO88507 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CntfrO88507 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CntfrO88507 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CntfrO88507 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CntfrO88507 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CntfrO88507 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CntfrO88507 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CntfrO88507 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CntfrO88507 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CntfrO88507 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CntfrO88507 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CntfrO88507 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CntfrO88507 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CntfrO88507 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CntfrO88507 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CntfrO88507 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CntfrO88507 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CntfrO88507 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CntfrO88507 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CntfrO88507 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CntfrO88507 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CntfrO88507 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CntfrO88507 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CntfrO88507 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CntfrO88507 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CntfrO88507 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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