Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AurkcO88445 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AurkcO88445 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AurkcO88445 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AurkcO88445 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AurkcO88445 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AurkcO88445 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AurkcO88445 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AurkcO88445 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AurkcO88445 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AurkcO88445 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AurkcO88445 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AurkcO88445 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AurkcO88445 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AurkcO88445 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AurkcO88445 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AurkcO88445 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AurkcO88445 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AurkcO88445 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AurkcO88445 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AurkcO88445 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AurkcO88445 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AurkcO88445 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AurkcO88445 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AurkcO88445 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AurkcO88445 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkcO88445 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkcO88445 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkcO88445 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkcO88445 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AurkcO88445 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AurkcO88445 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkcO88445 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkcO88445 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AurkcO88445 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AurkcO88445 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms