Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChadO55226 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChadO55226 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChadO55226 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChadO55226 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ChadO55226 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ChadO55226 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ChadO55226 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChadO55226 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChadO55226 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ChadO55226 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChadO55226 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChadO55226 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ChadO55226 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChadO55226 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChadO55226 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChadO55226 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChadO55226 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChadO55226 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChadO55226 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChadO55226 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChadO55226 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChadO55226 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChadO55226 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChadO55226 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChadO55226 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChadO55226 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChadO55226 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChadO55226 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChadO55226 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChadO55226 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChadO55226 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChadO55226 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ChadO55226 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChadO55226 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChadO55226 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChadO55226 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChadO55226 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChadO55226 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChadO55226 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChadO55226 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChadO55226 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChadO55226 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChadO55226 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChadO55226 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ChadO55226 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChadO55226 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChadO55226 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChadO55226 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChadO55226 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChadO55226 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChadO55226 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChadO55226 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChadO55226 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChadO55226 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChadO55226 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ChadO55226 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChadO55226 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChadO55226 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChadO55226 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChadO55226 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChadO55226 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChadO55226 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChadO55226 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChadO55226 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChadO55226 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChadO55226 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ChadO55226 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChadO55226 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChadO55226 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChadO55226 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChadO55226 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChadO55226 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChadO55226 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChadO55226 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChadO55226 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChadO55226 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ChadO55226 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ChadO55226 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChadO55226 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChadO55226 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChadO55226 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChadO55226 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChadO55226 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ChadO55226 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChadO55226 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChadO55226 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChadO55226 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChadO55226 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChadO55226 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChadO55226 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChadO55226 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChadO55226 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChadO55226 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChadO55226 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChadO55226 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChadO55226 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChadO55226 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChadO55226 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChadO55226 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms