Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pitpnm1O35954 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pitpnm1O35954 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pitpnm1O35954 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pitpnm1O35954 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pitpnm1O35954 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pitpnm1O35954 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pitpnm1O35954 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pitpnm1O35954 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pitpnm1O35954 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pitpnm1O35954 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pitpnm1O35954 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pitpnm1O35954 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pitpnm1O35954 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pitpnm1O35954 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms