Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phox2bO35690 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phox2bO35690 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phox2bO35690 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phox2bO35690 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phox2bO35690 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Phox2bO35690 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phox2bO35690 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phox2bO35690 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phox2bO35690 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phox2bO35690 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phox2bO35690 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phox2bO35690 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phox2bO35690 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phox2bO35690 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phox2bO35690 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phox2bO35690 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phox2bO35690 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phox2bO35690 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phox2bO35690 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phox2bO35690 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phox2bO35690 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phox2bO35690 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phox2bO35690 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms