Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk4O35493 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk4O35493 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk4O35493 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk4O35493 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clk4O35493 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk4O35493 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk4O35493 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clk4O35493 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk4O35493 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk4O35493 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk4O35493 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk4O35493 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk4O35493 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk4O35493 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk4O35493 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk4O35493 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk4O35493 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk4O35493 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms