Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd4O35226 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd4O35226 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd4O35226 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd4O35226 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd4O35226 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd4O35226 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd4O35226 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd4O35226 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms