Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif1cO35071 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif1cO35071 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif1cO35071 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kif1cO35071 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kif1cO35071 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kif1cO35071 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif1cO35071 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms