Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp616J3QN14 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp616J3QN14 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp616J3QN14 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp616J3QN14 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp616J3QN14 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp616J3QN14 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp616J3QN14 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms