Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tubgcp6G5E8P0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Tubgcp6G5E8P0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Tubgcp6G5E8P0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Tubgcp6G5E8P0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Tubgcp6G5E8P0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tubgcp6G5E8P0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Tubgcp6G5E8P0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tubgcp6G5E8P0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tubgcp6G5E8P0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Tubgcp6G5E8P0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Tubgcp6G5E8P0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Tubgcp6G5E8P0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Tubgcp6G5E8P0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Tubgcp6G5E8P0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Tubgcp6G5E8P0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Tubgcp6G5E8P0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tubgcp6G5E8P0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tubgcp6G5E8P0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Tubgcp6G5E8P0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Tubgcp6G5E8P0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Tubgcp6G5E8P0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Tubgcp6G5E8P0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tubgcp6G5E8P0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Tubgcp6G5E8P0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tubgcp6G5E8P0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Tubgcp6G5E8P0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Tubgcp6G5E8P0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tubgcp6G5E8P0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tubgcp6G5E8P0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tubgcp6G5E8P0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Tubgcp6G5E8P0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tubgcp6G5E8P0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Tubgcp6G5E8P0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tubgcp6G5E8P0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tubgcp6G5E8P0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Tubgcp6G5E8P0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Tubgcp6G5E8P0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms